Logo merupakan suatu gambar atau sekadar dengan arti tertentu, dan mewakili suatu arti dari  sebuah lembaga pendidikan  dalam hal Al Azhary yang berada pada naungan Yayasan Aji Yumika di desa lesmana kabupaten banyumas, dan hal lainnya membutuhkan sesuatu yang singkat dan mudah diingat sebagai sebuah lmbang dalam sebuah organisasasi 
Logo harus memiliki filosofi dan kerangka dasar berupa konsep dengan tujuan melahirkan sifat yang berdiri sendiri atau mandiri. Logo lebih lazim dikenal oleh penglihatan atau visual, seperti ciri khas berupa warna dan bentuk logo tersebut, oleh karena itu mi alazhary sendiri mejabarkan bahwa logo madrasah kami sendiri di buat  dan di desain sesuai dengan visi dan misi  dari lembaga pendidikan kami. Adanya lambang buku dan masjid menandakan bahwa lembaga pendidikan kami berada dalam pendidikan islam yang modern seperti harapan para pendiri lembaga pendidikan ini dan yaitu pihak yayasan dan orang tua.
Dalam dunia pendidikan islam yang modern kami tidak hanya bertumpu pada dunia modern saja namun kami menyembangkan semua baik dari sisi agama dan sisi modern semua sudah tersusun dalam rencana kerja madrasah yang ada dalam kutikulum kami antara lain tentang pemanfaatan dunia teknologi dan dunia pendidikan islam..
 Pada logo Al Azhary terdapat lambang masjid dan buku, masjid melambangkan madrasah merupakan tempat menuntut ilmu agama paling baik dari tahun ketahun, sedangkan buku melambangkan kita suci al qur`an dimana madrasah kami memiliki  visi dan misi dalam yaitu madrasah yang mengembangkan kurikulum berbasis al qur`an.